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R语言 | 决策曲线DCA绘制实战代码详解
295 2024-09-23
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大家好,我是菜鸟君。本文向大家分享关于决策曲线(Decision Curve Analysis,DCA)的R语言源码,应用于科研文献中。决策曲线是用来评估模型性能的重要指标。
由于多位同学对我在B站分享的R语言绘制DCA曲线的教程表示兴趣,并希望获得源码,我决定在这里详细介绍。
首先,我们要使用的R包是rmda,该包专门用于决策曲线分析。要开始分析,我们需要加载这个包,并使用R自带的示例数据集dcaData。这个数据集是一个包含癌症情况、性别、生物标记物等变量的临床队列研究数据。
接下来,我们构建一个基准模型作为参照。这个模型将癌症作为因变量,年龄、性别和吸烟情况作为自变量,但不包含特定的靶点数据。为了评估模型的稳定性,我们采用了10次随机重采样的方法。同时,决策曲线的x轴阈值也需要设置。
整个分析过程以及具体的R代码实现会在我们设置好所有的前提条件后进行讲解,确保读者能够顺利执行源码以绘制出自己的决策曲线。
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